Změnou nastavení zabezpečení lze přizpůsobit, jak bude aplikace Internet Explorer pomáhat chránit počítač před potenciálně škodlivým nebo nebezpečným webovým obsahem. Aplikace Internet Explorer automaticky přiřadí všechny weby k jedné ze zón zabezpečení: Internet, Místní intranet, Důvěryhodné servery nebo Servery s omezeným přístupem. Každá zóna má jinou výchozí úroveň zabezpečení, která určuje, jaký typ obsahu může být pro daný web blokován. V závislosti na úrovni zabezpečení webu může být některý obsah blokován, dokud ho nepovolíte, ovládací prvky ActiveX se nemusí spouštět automaticky nebo se na některých webech mohou zobrazit upozornění. Přizpůsobením nastavení pro jednotlivé zóny můžete určit požadovanou úroveň ochrany.