La característica Sistema de cifrado de archivos, disponible en las ediciones Business, Enterprise y Ultimate de Windows Vista, es útil para el cifrado de carpetas y de archivos del usuario. Por ejemplo, si dos usuarios comparten un equipo, el administrador podrá usar el Sistema de cifrado de archivos para cifrar los datos de cada usuario para que el otro no pueda verlos. En el caso del cifrado de carpetas y de archivos en red, Windows Vista ayuda a los administradores a almacenar las claves del Sistema de cifrado de archivos en tarjetas inteligentes.