Depende do programa, mas quaisquer alterações efectuadas estarão relacionadas com a forma como o Windows executa o programa. Não serão efectuadas alterações ao programa propriamente dito. Por exemplo, o Assistente de Compatibilidade de Programas Automático pode resolver conflitos utilizando o Controlo de Conta de Utilizador, uma nova funcionalidade de segurança incluída nesta versão do Windows que pode ajudar a tornar o seu computador mais seguro. Ou, pode executar o programa num modo que simula versões anteriores do Windows. As alterações são efectuadas automaticamente pelo Assistente de Compatibilidade de Programas Automático, pelo que não necessita de efectuá-las.