Najčastejšie sa súbory vytvárajú pomocou programu. Textový dokument môžete napríklad vytvoriť v programe na spracovanie textu, súbor s filmom v programe na úpravu videa.
Niektoré programy pri otvorení vytvoria súbor. Napríklad pri otvorení programu WordPad sa zobrazí prázdna strana. Tá predstavuje prázdny (a neuložený) súbor. Začnite písať a keď budete pripravení uložiť svoju prácu, kliknite na položku Súbor na paneli s ponukami a potom kliknite na príkaz Uložiť ako. Do zobrazeného dialógového okna zadajte názov súboru, ktorý vám pomôže v budúcnosti znova súbor nájsť, a potom kliknite na príkaz Uložiť.
V predvolenom nastavení väčšina programov ukladá súbory do všeobecných priečinkov, ako sú priečinky Dokumenty, Obrázky a Hudba, čo uľahčuje ich vyhľadanie pri ďalšom použití. Ďalšie informácie o vytváraní nových súborov nájdete v téme Uloženie súboru.
Nepotrebný súbor sa dá z pevného disku počítača odstrániť, čím sa ušetrí miesto a predchádza sa vzniku neporiadku spôsobenom nepotrebnými súbormi. Ak chcete súbor odstrániť, otvorte priečinok so súborom a potom súbor vyberte. Stlačte kláves DELETE a potom v dialógovom okne Odstránenie súboru kliknite na tlačidlo Áno.
Súbor sa po odstránení dočasne uloží do Koša. Kôš slúži ako bezpečnostný priečinok, ktorý umožňuje obnoviť náhodne odstránené súbory alebo priečinky. Kôš je potrebné občas vyprázdniť, aby sa uvoľnilo miesto na pevnom disku zabraté nepotrebnými súbormi. Ďalšie informácie o vyprázdňovaní Koša nájdete v téme Trvalé odstránenie súborov z Koša.